荧光显微镜的工作原理是将光学显微镜的放大特性与化合物的荧光发射特性相结合。荧光显微镜使用高强度光源激发被观察样品中的荧光分子(称为荧光团)。样品用荧光团标记,吸收来自光源的高强度光并发出能量较低、波长较长的光。然后用滤光片将产生的荧光与周围的辐射分开,使观察者只能看到荧光物质。生成的图像是被研究样本的放大版本。

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