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<img src="/icons/condense_yellow.svg" alt="/icons/condense_yellow.svg" width="40px" /> Python | C++ | 组学数据 | 阵列 | 序列 | 可视化 | 量化 | 基因 | 质量 | DNA | RNA | 遗传变异 | 蛋白质 | 氨基酸 | 血红蛋白 | 模式匹配 | 文本 | 正则表达 | 概率 | 比对 | 距离 | 密码子 | 频率 | 数据库 | 原子 | 细胞
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🎯要点
- Python和C++计算:
- 🎯生物计算:🖊分析和编辑序列文件 | 🖊微阵列数据分析:阵列图像转换为以二进制或文本格式保存的显着强度或可量化值 、可视化数据分布质量控制、分位数归一化比较数据、差异基因表达分析 | 🖊遗传或物理共表达基因的聚类图 | 🖊基因富集分析生物过程和分子途径 | 🖊单核苷酸多态性分析:药物反应与遗传变异的关联分析。🎯处理方式:🎯解析:🖊质谱数据整合到代谢途径 | 🖊核苷酸序列或氨基酸(蛋白质)序列文件解析 | 🖊序列数据库解析 | 🎯搜索:🖊RNA 序列转为蛋白质序列 | 🖊核苷酸序列或氨基酸(蛋白质)序列文件填入字典,定义对应的键和值 | 🖊创建蛋白质序列循环预测器 | 🖊从蛋白质数据库文提取氨基酸序列 | 🎯分类:🖊序列同一性百分比对输出排序 | 🖊对血红蛋白条目排序 | 🎯模式匹配和文本挖掘:🖊蛋白质正则表达式转换为 Python 正则表达式 | 🖊寻找基因组序列转录因子结合位点 | 🎯代码计算:🖊从核苷酸序列或氨基酸(蛋白质)序列文件文件加载蛋白质序列,计算每列的间隙分数 | 🖊创建与给定序列具有相同氨基酸或核苷酸组成的随机序列 | 🖊创建具有相同概率的核苷酸随机序列 | 🖊解析多个序列比对 | 🖊从多序列比对计算共识序列 | 🖊计算系统发育树节点之间的距离 | 🖊核苷酸序列中的密码子频率 | 🖊解析维也纳格式的 RNA 二维结构 | 🖊解析生物数据库 XML 输出和系统生物学标记语言文件 | 🖊执行生物数据库 | 🖊将蛋白质数据库文件拆分为蛋白质数据库链文件 | 🖊查找蛋白质数据库结构中两个最接近的原子 | 🖊提取两个蛋白质链之间的接口 | 🖊构建同源模型 | 🖊RNA 三维同源建模 | 🖊从 3D 结构计算 RNA 碱基对 | 🖊丝氨酸蛋白酶催化三联体。
- 分析工具:🎯分层交错布隆结构,快速查找生物序列 | 🎯量化大型测序数据集 | 🎯距离编辑精确成对序列比对 | 🎯高效的细胞计数分析
梗概
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