📚旁征博引

单细胞RNA测序 病例对照标签 生物信号 人类多发性骨髓瘤前体病症 恶性肿瘤 小鼠脱髓鞘模型 血脑屏障功能障碍 细胞高维转录分析 细胞变化 单细胞表达 扰动效应 降维 聚类 条件标签不均匀混合的潜在空间 生物异质性 统计框架 细胞类型混合 外周血单核细胞 异质性潜在空间 tSNE嵌入 接收者操作特征(AUROC)曲线 转录差异 标签预测模型的输入特征 人骨髓浆细胞 多发性骨髓瘤 单克隆丙种球蛋白病 前体样本 免疫球蛋白轻链基因 肿瘤纯度估计 肿瘤比例 置信区间 贝叶斯纯度模型 维恩图 超几何检验 胼胝体注射 溶血磷脂酰胆碱 白质损失 脱髓鞘 内皮细胞 体内平衡 髓鞘形成 组织修复 均匀分布 双峰分布 基因集富集分析 细胞外基质成分 血管壁 免疫细胞流入 基因表达矩阵 主成分分析 非负矩阵分解 逻辑回归 概率 k均值聚类 高斯混合模型 Kolmogorov-Smirnov(KS)检验 最近邻图 多项概率分布 标准Seurat函数 Leiden算法 特征选择

Python病例細胞生物訊號計算分析模型

Python病例細胞生物訊號計算分析模型

🎯要点

  1. 对照病例标签计算细胞干扰状态,对比真实数据分析生物信号。
  2. 使用外周血单核细胞 RNA 测序谱模拟干扰引起的细胞功能生物学变化。
  3. 使用降维方法预先处理标签预测模型的输入特征,并对比其他表征单细胞数据中的扰动效应的计算方法。
  4. 评估细胞的区分基因是否与已知的健康血浆和恶性肿瘤特征相匹配。

🍪语言内容分比

pie title 语言分比
 "Python":90
 "C/C++":20
 "其他":10
pie title 内容分比
 "算法模型":90
 "数学、降维、连续扰动估计、基因表达矩阵、概率、聚类分析":70
 "生物学、生物细胞学":50

✂️梗概

​Python分析基因

使用Python来分析基因通常会涉及读取基因序列数据、进行序列分析(如计算GC含量、查找开放阅读框)、功能注释以及基因表达分析等。下面是一个基础的代码示例,利用Python的Biopython库进行基因分析。

1. 安装Biopython

 pip install biopython

2. 导入库

 from Bio import SeqIO
 from Bio.SeqUtils import GC
 from Bio.Seq import Seq

3. 加载和分析基因序列

假设你有一个基因的FASTA格式文件,可以按照如下方式加载并分析: